“山鹰班”和“领航班”下面的第一层次，一共四个班，每个班人数在40到50人之间。这四个班的目标是：稳住211，冲刺985，保底一本线。学生来源不分市和县，中考总成绩在580分到600分之间。这些同学大多数来自学校所在辖区内统招生，极少部分来自辖区外。他们分配到的宿舍是四人间，和两人间宿舍的区别主要是没有每月100元的花费补贴，以及洗衣间是一个楼层两台，两个班配一个专业的生活老师。他们免除学费、住宿费和各种杂费，但没有每个月800元的校园卡打款，不过他们在食堂消费，除了每天至少一杯牛奶外，不强制要求每顿必须至少两个荤菜。每个班配一个班主任老师，要求每天早上7点10分到晚上10点之间必须在学校办公室值守。科任老师没有身份和头衔上的要求，但要求至少有五年以上教学经验或至少211大学研究生毕业并取得教师资格证，每天无论有课与否，早上7点10分到晚上10点必须在校，确保学生有疑问能及时找到老师解决。
第一层次的学生，每学期期末考试，如果成绩排名后退超过15名，下学期不再免除各种杂费，如果成绩排名后退超过30名，每学期950元的住宿也不再免除，如果成绩排名后退超过60名，所有费用不再免除，如果成绩排名掉落到全年级260名以外，调整出第一层次的班级，降到第二层次的班级；如果成绩排名进入全年级前30名或连续两次成绩排名进入前60名，调整出第一层次的班级，学生自行选择升入“山鹰班”还是“领航班”，享受全额奖学金待遇，宿舍调整到两人间。
第二层级的学生，被分成六个班，每个班不超60人。这个六个班的目标是：稳住一本线，冲刺211，保底本科线。这些同学的中考成绩在550分到570分之间，分配到的宿舍是6人间，和第一层次同学的区别是一层楼只有一台洗衣机，三个班配备一个专业生活老师。他们每学期免除一半学费，其他费用不能免除，没有每个月固定的校园卡打款，在食堂消费不被要求必须每天一杯牛奶和每顿买荤菜。每个班配一个班主任老师，要求每天早上7点10分到晚上10点之间必须在学校办公室值守。科任老师要求至少有三年以上教学经验或至少研究生毕业并取得教师资格证。教师实行坐班制，若有课，正常上课，若没有课，早上8点到下午5点半工作时间正常段在办公室坐班，5点半后，只要晚上没有晚自习，便可以离校回家。
第二层次的学生，每学期期末考试，如果成绩排名后退超过30名，下学期不再免除一半的学费，如果成绩排名后退超过100名，调整出第二层次的班级，降到第三层次的班级；如果成绩排名进入全年级前100名或连续两次成绩排名进入前200名，调整出第二层次的班级，升入第一层次，享受第一层次学生待遇。如果成绩排名进入全年级前60名，调整出第二层次的班级，暂时升入第一层次的班级，宿舍也暂时调整到四人间，其他的，享受和“山鹰班”和“领航班”学生同等待遇。如果紧接着第二次成绩排名进入全年级前30名或连续三次成绩排名都在全年级前60名，调整出第一层次的班级，学生自行选择升入“山鹰班”还是“领航班”，享受全额奖学金待遇，宿舍调整到两人间。
2005年云舟学校高中部最低录取分数线是501分，因此，那一年，中考成绩在501分到550分的同学都分在了第三层次。第三层次的目标是：站稳本科线，奋力冲刺211，绝不读大专。这些同学分配到的宿舍也是6人间，和第二层次同学的区别是一个楼层配备一个专业生活老师。他们不能免除任何费用，当然在食堂消费也没有任何要求，他们可以自由消费。每个班配一个班主任老师，要求每天早上7点10分到晚上10点之间必须在学校办公室值守。科任老师要求研究生毕业并取得教师资格证，或者学校圈定的211大学或985大学本科毕业并取得教师资格证。教师实行坐班制，若有课，正常上课，若没有课，早上8点到下午5点半工作时间正常段在办公室坐班，5点半后，只要晚上没有晚自习，便可以离校回家。
激励方面，第三层次的学生，有一个特别的奖项：如果三年后，若成功被211大学录取，一次性奖励现金3万元，若成功被985大学录取，一次性奖励10万元，若成功被清华或北大录取，一次性奖励现金20万元。
“有人拿得到过这个钱吗？”冯老师忍不住问。
“我在云舟学校的三年，拿到3万元现金奖励的同学还是有的，而且每年都有，10万和20万没有见到过。在那之前和之后我就不清楚了。”
“有个问题，你的讲述中没有提到过‘山鹰班’和‘领航班’的学生被降层次的情况。”
“因为那不可能发生，至少我在那里三年没有见到发生过。”林溪鸣说。
“为什么？安化四中尖子班不是照样有人被踢出来吗？”
“还记得我前面说到过，班主任老师专门把生物老师找来，生物老师用十几页PPT给我讲解牛奶对身体的益处吗？”林溪鸣问。
“这能说明什么问题？”